跳轉到

2012 · 萊夫科維茨與克比爾卡——受體如何接收訊號#

2012 諾貝爾化學獎:羅伯特·萊夫科維茨(Robert J. Lefkowitz,1943– ,美國)與布萊恩·克比爾卡(Brian Kobilka,1955– ,美國)——表彰「其對 G 蛋白偶聯受體之研究」。細胞最繁忙的「開關」終於被看見,並且看見了它「如何被關掉」。

懸案(案情提要)#

1970–90 年代的藥理學,有一個「數量上的尷尬」:

  • G 蛋白偶聯受體(GPCR)是細胞訊息傳遞的最大族群:人類約有 800 多種 GPCR 亞型,負責對光、氣味、激素、神經傳遞物質等數百種訊號的反應;
  • 它們無一例外都是藥物標靶:今日約 三分之一的處方藥作用於 GPCR(抗組織胺、\(\beta\)-阻斷劑、鴉片類、精神科藥物、阿茲海默症藥物…);
  • 但它們的結構長期不明——GPCR 是七次穿膜的膜蛋白(7TM),且在沒有配體結合時會自發地在多個構形間跳轉,極難結晶;
  • 而更根本的機制問題:
  • 配體結合後,受體如何「換檔」?GPCR 沒有酵素活性,它必須「撬動」細胞內的 G 蛋白(\(\mathrm{G}\alpha\))——這個「分子開關」的機制是什麼?
  • 受體如何「被關掉」?若只有「開」的機制而沒有「關」的機制,訊號將無法終止——受體的「去活化(desensitization)」機制(磷酸化與 \(\beta\)-arrestin 的結合)長期是黑箱;
  • 配體如何進入受體的「口袋」?藥物要結合的位点在膜內,藥物如何進去?
  • 為什麼同一個受體會對不同配體有不同效應?(完全激動劑、部分激動劑、逆向激動劑——「偏向性(bias)」。)

偵辦人:萊夫科維茨(受體生物學的建立者)與克比爾卡(結構的破解者)。

前因#

年份 事件
1943 / 1955 萊夫科維茨生於美國紐約;克比爾卡生於美國明尼蘇達州。
1960s–70s 萊夫科維茨在杜克大學任職,並與馬丁·羅德貝爾(Martin Rodbell)在范德比爾特大學共同進行開創性的放射免疫測定研究,建立「配體結合」的定量方法——他以放射配體(radioligand)測量受體的「結合位點數」與「親和力」。1967 年他發現「外源配體」與「內源配體」競爭同一受體——這是「受體存在」的證明,也是受體生物學的開端。
1970s–80s 萊夫科維茨系統描繪受體的「親和力狀態(affinity states)」與「向下調節(down-regulation)」;1975–80 年代他與索爾·科恩(Martin Rodbell)提出「受體—G 蛋白偶聯的『功能開關』」概念,並以生化方法分離出「G 蛋白」。
1980s–90s 克比爾卡在卡內基(Carnegie)研究所研究\(\beta\)-腎上腺素受體(\(\beta_{2}\mathrm{AR}\)):1990–2000 年代,他以基因工程、置換突變、傅立葉轉換紅外光譜(FTIR)等手段研究受體的構形變化,並用抗體 Fab 片段作為「晶格外穩定劑(crystallization chaperone)」——這是破解 GPCR 結構的關鍵技術。
2000s 克比爾卡團隊(與其合作者)持續用小分子(PDB 的配體)與抗體 Fab作為「晶格外穩定劑」,逐一取得不同配體結合態的受體晶體。
2011 克比爾卡團隊發表 \(\beta_2\) 受體與工程化 G 蛋白的複合體結構(\(3.5\ \text{Å}\))——第一次看見受體與 G 蛋白的直接接觸**。
2012 萊夫科維茨與克比爾卡共享諾貝爾化學獎。
2012–2015 克比爾卡團隊解出與 \(\mathrm{G}\alpha\) 結合的受體結構,並揭示「偏向性訊號」的結構基礎(不同配體穩定不同的中間構形);2015 年他獲得「Breakthrough Prize in Life Sciences」。

調查#

偵查一:受體存在的證明——「競爭結合」。

\[\text{放射標記配體(} {}^3\mathrm{H}\text{-配體)} + \text{膜製備物} \xrightarrow{} \text{結合量} \sim B_{\max}\]
\[\text{加入過量非標記配體} \xrightarrow{} \text{結合量骤降(競爭)} \Rightarrow \textbf{存在可飽和的立體專一結合位點}\]
\[\text{「可飽和 + 立體專一 + 高親和力」= \text{受體的三個判準}}\]

「放射配體結合法」是 1960–90 年代藥理學的標準裝備——它讓「受體」從概念變成可測量的對象。

偵查二:結構的難題與「晶格外穩定劑」。

\[\text{GPCR 的三重困難}:\begin{cases}\text{七次穿膜(跨膜區極疏水)}\\ \text{無配體時自發跳轉(多構形)}\\ \text{配體口袋在膜内、入口狹窄}\end{cases}\]
\[\text{克比爾卡的兩把鑰匙}:\begin{cases}\text{① 工程化}(\text{加入} \mathrm{N} \text{端、刪除} \mathrm{C} \text{端、用穩定突變} \mathrm{L} \to \mathrm{A}\text{)}\\ \text{② 晶格外穩定劑(Fab 抗體片段或小分子配體)}\end{cases}\]
\[\boxed{\text{「Fab 抗體片段」的作用}:\ \text{它不結合配體結合位,但能抓住受體的「外面」,阻止其回到低親和力的鬆散態}}\]

「用抗體當支架」的智慧,是本案最值得記錄的技術思想。

偵查三:受體—G 蛋白的接觸面——「分子開關的鉸鏈」。

\[\mathrm{GPCR}\ \text{的胞内端(TM6, TM7, helix 8)} \xrightarrow{} \text{與} \mathrm{G}\alpha\ \text{的} \textbf{N}\text{端螺旋(NTD)直接接觸}\]
\[\text{機制}:\ \text{配體結合} \xrightarrow{} \text{受體胞内腔擴大} \xrightarrow{} \text{胞内端的「鉸鏈」打開} \xrightarrow{} \text{形成} \textbf{G 蛋白結合凹槽(cavities)}\]
\[\text{於是} \mathrm{G}\alpha\ \text{的 NTD「掉入」凹槽} \xrightarrow{} \textbf{G 蛋白被撬開 GDP/GTP 交换的开关}\]
\[\boxed{\text{「受體不是酵素,但它是酵素的『啟動器』」——它用構形變化撬動另一個酵素}}\]

偵查四:去活化的機制——「把開關關掉的機制」。

\[\mathrm{GPCR}\xrightarrow{\text{配體結合}}\mathrm{GPCR}^*\xrightarrow{\text{GRK 磷酸化}}\mathrm{GPCR}{-}\mathrm{P}\xrightarrow{+\beta\text{-arrestin}}\textbf{去活化 + 訊號偏置}\]
\[\text{結果}:\ \text{① 受體不再與 G 蛋白偶聯};\qquad \text{② 訊號轉向} \beta\text{-arrestin 途徑(偏置訊號)}\]

「同一個受體可以發出兩種不同的訊號,取決於它被『關掉』的方式」——這是 \(\beta\)-arrestin 偏置訊號(biased signaling)的發現,也是 2012 年諾貝爾獎講座的重要內容。

偵查五:結構預測的驗證——「用 AlphaFold 檢驗 2012 年的結構」。

\[\text{2021 年以後}:\ \text{GPCR 的 AlphaFold 預測結構} \xrightarrow{\text{與} \ 2012\text{ 年的實測結構比較}} \text{高度吻合}\]

這是 2020 年代結構預測的一次「事後驗證」——AlphaFold 預測的多重膜蛋白結構與克比爾卡團隊十年間取得的數十個 GPCR 結構幾乎一致(僅在配體口袋與構形動態上有差異)。

理論裁決#

判決一:受體是「構形開關」,不是「配體識別器」。

\[\text{受體的機制} \ne \text{「辨識配體」};\quad \text{而是} \textbf{「把配體的結合能轉換成自身的構形變化」}\]
\[\text{這就是} \ \textbf{結構傳訊(allostery)}\text{在膜受體上的表現}\]
\[\text{並與} \ [1969-\text{巴頓與構象分析}]\text{(構象分析的原理)、}[1997-\text{博耶與ATP合成酶}]\text{(構形驅動機器)} \text{同屬一個家族}\]

判決二:偏置訊號——「配體不只帶來『開』,還帶來『開哪一種』」。

\[\begin{array}{l} \text{完全激動劑}:\ \text{受體的所有構形被 populated} \Rightarrow \text{G 蛋白訊號} + \text{arrestin 訊號}\\ \text{部分激動劑}:\ \text{只穩定部分構形} \Rightarrow \text{G 蛋白訊號較弱}\\ \text{逆向激動劑}:\ \text{穩定「不活化的中間構形」} \Rightarrow \text{G 蛋白訊號為負}\\ \text{偏置激動劑}:\ \text{偏愛} \ \textbf{arrestin}\ \text{構形} \Rightarrow \text{G 蛋白訊號弱而 arrestin 訊號強} \end{array}\]
\[\boxed{\text{「同一受體,不同配體,不同訊號」——這是 2012 年諾貝爾獎最深遠的生物學意涵}}\]

「配體不只打開開關,還決定開關往哪個方向轉」——這改變了藥理學的核心語言,並直接導致「偏置配體」的藥物開發。

判決三:結構傳訊的藥理學應用。

\[\text{藥物設計}:\ \text{不只問「結合強度」} \Rightarrow \text{還要問「穩定哪個構形」}\]
\[\text{今日的 GPCR 藥物開發}:\ \text{以} \textbf{受體-G 蛋白複合體的結構}\text{為基礎,設計「穩定特定構形」的配體}\]

「用結構設計偏置配體」是 2010 年代 GPCR 藥理學的核心策略。

判決四:方法論的傳承。

\[\text{1990 年代}:\ \text{受體生物學(} \text{放射性配體} \text{)} \xrightarrow{} \text{結構}(\text{晶格外穩定劑} \text{)} \xrightarrow{} 2020\text{年代}:\text{AlphaFold 預測}\]
\[\text{這是「結構 → 機制 → 藥物」這條鏈條最成功的一次完整示範}\]

後果#

領域 影響
藥理與藥物 GPCR 結構成為結構基礎藥物設計的最大產出領域;今日已有數十個以 GPCR 結構為基礎設計的藥物進入臨床。
神經科學 GPCR 訊號傳遞在神經系統中的多樣性(受體偏置是行為與藥理差異的重要來源)被重新理解。
免疫與發炎 趨化因子受體(CXR)等 GPCR 與發炎、腫瘤免疫相關。
結構生物學 「晶格外穩定劑」這一招沿用於許多其他膜蛋白(今日的 GPCR 結構數已逾 800 個)。
科學制度 萊夫科維茨是美國心臟協會、中國科学院(外籍院士)等多個科學組織的主席,是科學公民的典型;克比爾卡獲 2015 年突破獎,說明此領域的社會影響力。

關聯#