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2022 · 貝爾托西、梅爾達爾與沙普萊斯——點擊化學與生物正交#

2022 諾貝爾化學獎:卡羅琳·R·貝爾托西(Carolyn R. Bertozzi,1966– ,美國)、莫滕·梅爾達爾(Morten Meldal,1954– ,丹麥)與卡爾·巴里·沙普萊斯(Karl Barry Sharpless,1941– ,美國)——表彰「其對點擊化學與生物正交化學的發展」。讓分子在生物體裡「咔嗒」一聲接上,而不驚動任何其他分子。

懸案(案情提要)#

1990 年代的化學與生物學交界面,有一個「不可能的三角」:

  • 生物分子要能在活體內研究(否則無法知道藥物在細胞裡做什麼);
  • 要能「定點」地修改生物分子(不然無法追蹤特定蛋白質);
  • 但生物體是極度選擇性的——細胞裡有數千種小分子與上萬種蛋白質,任何化學試劑都會與它們發生反應;
  • 而化學家手上的工具(活性酯、碘、SAM 輔酶等)在生物環境中立刻被消耗或被非目標分子吃掉;
  • 懸案因此是:能不能設計一套化學反應,在活的生物體裡,只與指定的目標分子反應,而不與其它任何分子反應?

偵辦人:貝爾托西(生物正交化學的建立者與「click 化學」的醫藥應用推動者)、梅爾達爾(CuAAC 點擊化學的共同開發者)與沙普萊斯(CuAAC 的發現者與「click 化學」一詞的命名者)。

前因#

年份 事件
1966 / 1954 / 1941 貝爾托西生於美國波士頓;梅爾達爾生於丹麥哥本哈根;沙普萊斯生於美國密蘇里州(他在史丹福的固體化學與不對稱催化工作見 2001-諾爾斯與手性催化)。
1990s 貝爾托西在舊金山加州大學(UCSF)研究細胞表面醣蛋白的「醣萼(glycocalyx)」,並提出了「生物正交化學(bioorthogonal chemistry)」的概念(1999 年在 Angew. Chem. 的綜述中明確提出)。
1993 貝爾托西的「細胞表面標記」實驗:她證明叠氮基(\(\mathrm{N_3}\))與生物體內的天然官能基完全不反應——因此可以用「帶叠氮的外源分子」標記細胞表面,而不打擾細胞的其餘部分。這是生物正交化學的第一塊磚。
1998 梅爾達爾與沙普萊斯各自獨立發現 CuAAC(銅催化的叠氮–炔基環加成):\(\mathrm{Cu(I)}\) 催化的 1,3-偶極環加成產生的 1,2,3-三唑(triazole)在生物條件下幾乎 100% 地生成——極其高效,「像子彈一樣」的可靠。
2004 沙普萊斯提出「click 化學」一詞:他觀察到,CuAAC 反應在水與常溫下即可進行,產率極高,且產物不需進一步衍生——因此他把这类反應稱為「click(點擊)」反應,並提出「click chemistry」的廣義定義。
2000s 梅爾達爾發展環加成之外的 click 反應:Pd 催化的炔–疊氮 Sonogashira 偶聯、以及環狀烯(cyclooctyne)的「應變促進」(strain-promoted)疊氮–烯基環加成(SPAAC)——這是「完全不用銅」的點擊化學,對活體研究至關重要(銅對細胞有毒)。
2000s–2010s 貝爾托西將 click 化學用於細胞表面醣蛋白成像(2004 年以「生物正交標記」追蹤細胞表面的醣蛋白)、腫瘤的糖抗原成像、以及藥物的「點擊釋放」(click-to-release)機制。
2010s 「生物正交化學」的定義成熟:可在活體內、且不與天然生物分子顯著反應的化學反應。
2022 三人共享諾貝爾化學獎(沙普萊斯因此兩度獲獎:2001 與 2022)。

調查#

偵查一:生物正交性的「兩條規則」。

\[\boxed{\text{① 反應在生物環境中可行(} \mathrm{H_2O}\text{、生理} pH\text{、} 37\,^\circ\mathrm{C}\text{、不改變其他分子)}}\]
\[\boxed{\text{② 反應的產物(或起始物)不與天然生物分子反應}}\]

「疊氮基(\(\mathrm{-N_3}\))」為何是首選?

\[\begin{array}{l} \text{① 天然生物分子中幾乎沒有疊氮基(只有小部分糖蛋白含氮糖)}\\ \text{② 疊氮基在生理條件下穩定(不與胺基、硫醇、羰基反應)}\\ \text{③ 但疊氮基可被專屬的化學選擇性地「捕捉」(點擊)} \end{array}\]

「生物正交」的精妙之處:它的「正交性」是雙向的——不僅不干擾生物體,也不被生物體消耗。

偵查二:CuAAC 的機構——「為什麼這麼可靠」。

\[\mathrm{R{-}N_3} + \mathrm{R'{-}C{\equiv}CH} \xrightarrow{\mathrm{Cu(I)}\ (\text{配體})} \text{1,2,3-三唑(1,4-二取代)}\]
\[\text{機構}:\ \mathrm{Cu(I)}\ \text{與炔基形成} \mathrm{Cu}\text{-炔基} \xrightarrow{} \text{疊氮配位} \xrightarrow{} \text{環加成} \xrightarrow{} \text{質子解離}\]
\[\boxed{\text{「熱力學驅動力極大 + 選擇性極高 + 條件極溫和} \Rightarrow \textbf{「像子彈一樣可靠」的點擊反應}}\]

CuAAC 是有機催化史上的標誌性反應——今日在化學生物學、DNA 測序(Illumina 的 surface chemistry)、材料化學與藥物合成中無處不在。

偵查三:SPAAC——「把銅拿掉」。

\[\mathrm{ strained\ cyclooctyne} + \mathrm{R{-}N_3} \xrightarrow{\text{無催化劑}} \text{三唑}\]
\[\text{環張力} \xrightarrow{} \text{降低環加成能障} \xrightarrow{} \text{可在活細胞內直接使用}\]
\[\boxed{\text{「環張力代替催化劑」——這是化學家對生物環境限制的直接回答}}\]

偵查四:從「點擊」到「生物正交」的完整工具箱。

反應 條件 標的 用途
CuAAC \(\mathrm{Cu(I)}\),需避氧 疊氮 體外、蛋白質標記
SPAAC 無催化劑 疊氮 活細胞、活體
Staudinger ligation(無銅版) 膦酸酯 + 疊氮 疊氮 生物正交的經典反應
tetrazine ligation(Tz/TCO) 無催化劑、極快(\(\sim 10^4\)–\(10^6\ \mathrm{M^{-1}s^{-1}}\)) TCO 活體成像的超快標記
\[\text{(另:貝爾托西的} \textbf{光去保護(photouncaging)}\text{以} \mathrm{aryl\ azide}\text{為「光開關」,可在特定位置以光釋放功能基)}\]

偵查五:貝爾托西的「藥理學的精確定位」。

\[\text{傳統藥物}:\ \text{全身作用} \xrightarrow{} \text{副作用}\]
\[\text{精確定位}:\ \text{把藥物的「活性部分」用} \textbf{生物正交把手}\text{連到一個只結合特定腫瘤的抗體上}\]
\[\text{或在腫瘤內以局部光照} \xrightarrow{} \text{光解釋放} \textbf{活性藥物}\]
\[\boxed{\text{「點擊化學使藥物的『作用位置』可以被設計」——這是精準藥物的化學基礎}}\]

偵查六:沙普萊斯的「點擊化學」宣言。

\[\text{他的判準}:\begin{cases}\text{① 模組化(模組之間可互換)}\\ \text{② 高產率}\\ \text{③ 條件溫和}\\ \text{④ 產物易於分離(不需衍生)}\end{cases}\]
\[\text{他更提出「『點擊化學』不是某一個反應,而是一整套反應的選擇哲學」}\]

理論裁決#

判決一:正交性的數學化——「交叉反應矩陣為空」。

\[\text{定義}:\ \text{反應} A_i \text{與底物} B_j \text{的反應矩陣} \mathbf{R}_{ij}\]
\[\boxed{\text{生物正交} \iff \mathbf{R}_{ij} \approx 0\ \text{對所有「非目標」} (i,j)}\]
\[\text{即}:\ \text{人工反應與天然生物化學之間的} \textbf{交叉反應} \text{必須可忽略}\]

「正交性」把化學選擇性從「對某個底物高」提升為「對其他一切低」——這是一個更高階的選擇性定義。

判決二:點擊反應的熱力學與選擇性——「可靠性的來源」。

\[\mathrm{R{-}N_3} + \mathrm{R'{-}C{\equiv}CH} \to \text{三唑}:\ \Delta H \ll 0,\ \Delta S < 0\ (\text{但} \ \Delta H\ \text{之大足以抵銷})\]
\[\text{選擇性}:\ \mathrm{Cu(I)}\ \text{對炔的親和} \xrightarrow{} \text{疊氮不與炔競爭} \xrightarrow{} \textbf{幾乎 100\% 的三唑產物(1,4-二取代)}\]
\[\boxed{\text{「反應的可靠」不是靠多步平衡,而是靠} \textbf{單步近乎定量} \text{的熱力學驅動}}\]

這與 1984 年梅里菲爾德的固相合成(見 1984-梅里菲爾德與固相合成)共享同一個設計哲學:每一步都近乎定量,整體才可靠。

判決三:生物正交化學使「空間特異性」可编程。

\[\underbrace{\text{靶點選擇(分子層面)}}_{\text{點擊把手}} \times \underbrace{\text{位置選擇(空間層面)}}_{\text{光解釋放}} = \textbf{「四維精準」的分子操作}\]
\[\text{時間維度}:\ \text{以光脈衝控制釋放的時機}\]
\[\text{這是化學第一次能「在特定時間、特定位置、特定分子」上施加作用}\]

判決四:與酵素的對照。

\[\begin{array}{l} \text{酵素}:\ \text{蛋白質} + \text{底物} \xrightarrow{} \text{產物} \quad(\text{選擇性來自立體互補})\\ \text{點擊化學}:\ \text{疊氮} + \text{炔} \xrightarrow{} \text{三唑} \quad(\text{選擇性來自} \textbf{「一鍵一鎖」的化學正交性}) \end{array}\]
\[\boxed{\text{「酵素用形狀辨認;點擊化學用} \textbf{電子的正交性}\text{辨認」}}\]

「不是用形狀,而是用『化學上互不往來』來辨認」——這是 2022 年諾貝爾獎最深刻的思想轉變。

後果#

領域 影響
化學生物學 今日化學生物學(chemical biology)的核心工具箱;活細胞與活體的蛋白質標記、成像與追蹤。
醫學 ADC(抗體藥物偶聯物)的 payload 連接即用 click 化學;光觸發藥物釋放(click-to-release);腫瘤的醣抗原成像。
診斷 生物正交標記用於 PET/光學成像;快檢測(如以 click 化學做生物標記的側向流檢測)。
材料與奈米 「click 化學」用於表面功能化、奈米粒子偶聯、聚合物刷的製備;DNA 測序(Illumina)的表面化學即建立在疊氮/炔的化學上。
科學史 沙普萊斯兩度獲諾貝爾獎(2001 不對稱催化、2022 點擊化學),成為「同一個人用不同方法解決同一問題(選擇性與正交性)」的罕見案例。

關聯#