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3.1 Pearson 卡方檢定與相關:生物統計學誕生(1900)【數學↔生物】#

前因:生物變異需要新數學#

19 世紀末,Galton(達爾文的表弟)研究身高遺傳,發現「子代身高回歸平均值」——但物理學的誤差理論(高斯分佈)假定真值唯一,而生物的變異本身就是主體。Karl Pearson 為處理族群內的連續變異,創建一套新統計工具,並於 1901 年創辦《Biometrika》期刊——「生物統計學」(Biometry)正式命名。

構造#

三大發明:

  1. 相關係數(1896):度量兩變數的線性共同變化
\[r = \frac{\sum (x_i - \bar x)(y_i - \bar y)}{\sqrt{\sum (x_i - \bar x)^2 \sum (y_i - \bar y)^2}} \in [-1, 1]\]

回答「親子身高有多相關」——這正是 Galton 迴歸的量化。

  1. 卡方檢定(1900):檢驗觀察頻率是否符合理論期望
\[\chi^2 = \sum_i \frac{(O_i - E_i)^2}{E_i}\]

Pearson 證明其漸近分佈自由度為 \(k-1\) ——這是第一個現代意義的假設檢定,統計推論的起點。它立即被用來檢驗孟德爾的 3:1 比例。

  1. 主成分分析(1901):把多變數變異投影到主軸——源自生物測量的降維需求,日後成為機器學習的基石。

後果#

  1. 科學方法的制度化:「提出零假設 → 計算檢定統計量 → 給出顯著水準」成為 20 世紀實證科學的標準流程,源頭即生物學需求。
  2. 學派衝突埋下伏筆:Pearson 的連續變異觀點與孟德爾的離散顆粒觀點激烈對立——魚與熊掌能否兼得?答案由 Fisher 給出(3.2)。
  3. 醫學的量化革命:從 1948 年第一個隨機對照試驗(鏈黴素治療結核)到今日所有臨床試驗,方法論全部回溯到 Pearson–Fisher 傳統。

練習與思考#

  1. 觀察 556 顆豌豆中圓 423 皺 133,用 \(\chi^2\) 檢定是否符合 3:1。( \(E: 417, 139\) , \(\chi^2 \approx 0.35\) ,不顯著——孟德爾過關。)
  2. 相關不等於因果——舉一個生物醫學的例子(如吸菸與咖啡攝取的相關)說明混淆變數。